On chip integrated sample preparation for proteomics
(2005)- Abstract
- The aim of this thesis project has been to create miniaturized analytical tools that improve sample preparation for the very rapidly growing field of proteomics research. The presented miniaturized analytical tools provide novel and generic analytical solutions, which are highly adaptable for analysis of various low abundant biomolecules. The adaptability and generality of the analytical technology is very important since there are a great diversity both in the analysis methods used and the biomolecules themselves. This technology is achieved through the use of silicon micromachning. The thesis presents microstructure developments both in the form of improvements of existing technology and new hardware in the form of microstructures for... (More)
- The aim of this thesis project has been to create miniaturized analytical tools that improve sample preparation for the very rapidly growing field of proteomics research. The presented miniaturized analytical tools provide novel and generic analytical solutions, which are highly adaptable for analysis of various low abundant biomolecules. The adaptability and generality of the analytical technology is very important since there are a great diversity both in the analysis methods used and the biomolecules themselves. This technology is achieved through the use of silicon micromachning. The thesis presents microstructure developments both in the form of improvements of existing technology and new hardware in the form of microstructures for sample preparation purposes in proteomics. This is achieved by integrated on-chip sample preparation enabling enrichment and sensitive analysis by mass spectrometry.
A sample preparation platform (spot-on-a-chip) consisting of a microdispenser and nanovial arrays enables efficient protein enrichment and sensitive microspot sample preparation for Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) analysis is presented. Technology for improved enzymatic digestion and highly efficient solid-phase microextraction is also demonstrated. (Less) - Abstract (Swedish)
- Popular Abstract in Swedish
Internationellt satsas det inom bioteknologin för närvarande miljardbelopp på
utveckling av mikrosystem för avancerad genom- och proteomikforskning. Genomet
avser den uppsättning arvsanlag som varje individ har i varje enskild cell och
proteomet är den mängd proteiner som finns i varje organism (cell). Den mängd
information som döljer sig i genomet och proteomet för en organism är otroligt
stor. Utveckling av mikroteknologi som tillåter snabba och billiga storskaliga studier
av proteomet och dess koppling till genomet kommer därför att vara essentiell för
den... (More) - Popular Abstract in Swedish
Internationellt satsas det inom bioteknologin för närvarande miljardbelopp på
utveckling av mikrosystem för avancerad genom- och proteomikforskning. Genomet
avser den uppsättning arvsanlag som varje individ har i varje enskild cell och
proteomet är den mängd proteiner som finns i varje organism (cell). Den mängd
information som döljer sig i genomet och proteomet för en organism är otroligt
stor. Utveckling av mikroteknologi som tillåter snabba och billiga storskaliga studier
av proteomet och dess koppling till genomet kommer därför att vara essentiell för
den medicinska och farmakologiska forskningens framsteg. Dessa forskningsframsteg
kommer att medföra utveckling av diagnostik och läkemedel för behandling av
många idag svåra eller obotliga sjukdomar (Alzheimers, Cancer, m.fl.). Proteiner
och peptider är involverade i alla funktioner och aktiviteter i levande celler. Ur
farmaceutisk synvinkel är de proteiner/peptider som är inblandade i olika signaloch
regulativa processer i cellerna särskilt intressanta. Analys av proteiner kan ge
både diagnostisk information och information om substans effektivitet. Det finns
därför ett starkt intresse inom både biokemi, cell och molekylär biologi och den
farmaceutiska industrin för utveckling av analyssystem som tillåter snabb och känslig
analys av protein-/peptidprover. Då dessa prover oftast har väldigt liten volym
(1-10 µl) så är mikrostrukturer i kombination med masspektrometri en idealisk
kombination.
I de presenterade publikationerna visas hur proteomikanalys kan förbättras genom
kombination av mikroteknologi och masspektrometri (MALDI-MS). Den
presenterade mikroteknologin tillåter analys med högre känslighet och mindre
provvolymer än vad som är möjligt med konventionella metoder. (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
https://lup.lub.lu.se/record/545772
- author
- Ekström, Simon LU
- supervisor
- opponent
-
- Professor Foret, Frantisek, Institute of Analytical Chemistry
- organization
- publishing date
- 2005
- type
- Thesis
- publication status
- published
- subject
- keywords
- Elektroteknik, Electrical engineering, enzymologi, Proteiner, enzymology, Proteins, Analytisk kemi, sample preparation, mass spectrometry, microfluidics, miniaturization, Biochemical technology, proteomics, Analytical chemistry, Biokemisk teknik
- pages
- 173 pages
- publisher
- Department of Electrical Measurements, Lund University
- defense location
- Room Kårhusets Hörsal, John Ericssons väg 3, Lund Institute of Technology
- defense date
- 2005-12-09 10:15:00
- external identifiers
-
- other:ISRN:lutedx/teem-1083-se
- ISBN
- 91-628-6692-3
- language
- English
- LU publication?
- yes
- id
- 6f5a79ea-35c7-4a62-b2ae-a45545bcc9e0 (old id 545772)
- date added to LUP
- 2016-04-01 17:08:12
- date last changed
- 2018-11-21 20:46:55
@phdthesis{6f5a79ea-35c7-4a62-b2ae-a45545bcc9e0,
abstract = {{The aim of this thesis project has been to create miniaturized analytical tools that improve sample preparation for the very rapidly growing field of proteomics research. The presented miniaturized analytical tools provide novel and generic analytical solutions, which are highly adaptable for analysis of various low abundant biomolecules. The adaptability and generality of the analytical technology is very important since there are a great diversity both in the analysis methods used and the biomolecules themselves. This technology is achieved through the use of silicon micromachning. The thesis presents microstructure developments both in the form of improvements of existing technology and new hardware in the form of microstructures for sample preparation purposes in proteomics. This is achieved by integrated on-chip sample preparation enabling enrichment and sensitive analysis by mass spectrometry.<br/><br>
<br/><br>
A sample preparation platform (spot-on-a-chip) consisting of a microdispenser and nanovial arrays enables efficient protein enrichment and sensitive microspot sample preparation for Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) analysis is presented. Technology for improved enzymatic digestion and highly efficient solid-phase microextraction is also demonstrated.}},
author = {{Ekström, Simon}},
isbn = {{91-628-6692-3}},
keywords = {{Elektroteknik; Electrical engineering; enzymologi; Proteiner; enzymology; Proteins; Analytisk kemi; sample preparation; mass spectrometry; microfluidics; miniaturization; Biochemical technology; proteomics; Analytical chemistry; Biokemisk teknik}},
language = {{eng}},
publisher = {{Department of Electrical Measurements, Lund University}},
school = {{Lund University}},
title = {{On chip integrated sample preparation for proteomics}},
year = {{2005}},
}