Advanced

Distortion in 3T clinical fMRI data

Mannfolk, Peter (2003)
Medical Physics Programme
Abstract
Functional MRI (fMRI) is a technique for determining which parts of the brain are activated when a subject experiences some type of physical sensation or performs an activity. This technique has during the past several years become a very useful tool for understanding functions of the nervous system, and the development of clinical applications is rapidly progressing. However, fMRI is not straightforward and attention must be paid to many details in the process. One necessity when performing an fMRI experiment is the use of very rapid imaging techniques. Images acquired with these techniques suffer from different types of artefacts such as geometric distortion, which could for example lead to misinterpretation of activation maps, or can be... (More)
Functional MRI (fMRI) is a technique for determining which parts of the brain are activated when a subject experiences some type of physical sensation or performs an activity. This technique has during the past several years become a very useful tool for understanding functions of the nervous system, and the development of clinical applications is rapidly progressing. However, fMRI is not straightforward and attention must be paid to many details in the process. One necessity when performing an fMRI experiment is the use of very rapid imaging techniques. Images acquired with these techniques suffer from different types of artefacts such as geometric distortion, which could for example lead to misinterpretation of activation maps, or can be misleading when using fMRI for presurgical planning. The main objective of this work was to evaluate the effects of geometric distortion when performing fMRI experiments at the 3T dedicated head scanner (Siemens Magnetom Allegra) at Lund University Hospital. A correction method based on the evaluation technique was also implemented and applied to the distorted images. (Less)
Abstract (Swedish)
Funktionell magnetresonanstomografi (fMRI) är en teknik som gör det möjligt att kartlägga aktivering inom olika delar av hjärnan. Genom att samla in bilddata då patienten är i vila, och sedan jämföra dessa med data insamlade medan patienten är aktiv (t.ex. utför fingerrörelser), kan en bild skapas som visar var i hjärnan aktivering har skett. Dessa bilder kan t.ex. användas för att bedöma om det är möjligt att operera bort en tumör utan att samtidigt skada viktiga funktionscentra i hjärnan.

För att kunna genomföra en funktionell studie krävs mycket snabba bildtagningssekvenser. Dessa ger dock bilder som på olika sätt innehåller störningar, vilket kan ge upphov till feltolkning av resultaten. Detta projekt har haft som mål att mäta... (More)
Funktionell magnetresonanstomografi (fMRI) är en teknik som gör det möjligt att kartlägga aktivering inom olika delar av hjärnan. Genom att samla in bilddata då patienten är i vila, och sedan jämföra dessa med data insamlade medan patienten är aktiv (t.ex. utför fingerrörelser), kan en bild skapas som visar var i hjärnan aktivering har skett. Dessa bilder kan t.ex. användas för att bedöma om det är möjligt att operera bort en tumör utan att samtidigt skada viktiga funktionscentra i hjärnan.

För att kunna genomföra en funktionell studie krävs mycket snabba bildtagningssekvenser. Dessa ger dock bilder som på olika sätt innehåller störningar, vilket kan ge upphov till feltolkning av resultaten. Detta projekt har haft som mål att mäta storleken på störningar i funktionella studier, för att på så sätt kunna bedöma resultatens tillförlitlighet.

Ett datorprogram har skrivits, vilket förutom att analysera bilder med störningar även gör en korrektion av dessa. (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
author
Mannfolk, Peter
supervisor
organization
year
type
H2 - Master's Degree (Two Years)
subject
keywords
MRI
language
English
id
2156899
date added to LUP
2011-09-13 15:34:48
date last changed
2011-12-06 11:01:31
@misc{2156899,
  abstract     = {Functional MRI (fMRI) is a technique for determining which parts of the brain are activated when a subject experiences some type of physical sensation or performs an activity. This technique has during the past several years become a very useful tool for understanding functions of the nervous system, and the development of clinical applications is rapidly progressing. However, fMRI is not straightforward and attention must be paid to many details in the process. One necessity when performing an fMRI experiment is the use of very rapid imaging techniques. Images acquired with these techniques suffer from different types of artefacts such as geometric distortion, which could for example lead to misinterpretation of activation maps, or can be misleading when using fMRI for presurgical planning. The main objective of this work was to evaluate the effects of geometric distortion when performing fMRI experiments at the 3T dedicated head scanner (Siemens Magnetom Allegra) at Lund University Hospital. A correction method based on the evaluation technique was also implemented and applied to the distorted images.},
  author       = {Mannfolk, Peter},
  keyword      = {MRI},
  language     = {eng},
  note         = {Student Paper},
  title        = {Distortion in 3T clinical fMRI data},
  year         = {2003},
}