In vitro screening for key RNA modifying enzymes in prostate cancer metastases
(2023) MOBN02 20222Degree Projects in Molecular Biology
- Popular Abstract (Swedish)
- En potentiell biomarkörer för prostatacancer metastaser
Prostatacancer (PCa) är den vanligaste cancerformen hos män i industriländer. Då den primära tumören inte längre är en stor utmaning för dagens medicin, är den metastaserande sjukdom den främsta orsaken till cancerrelaterade dödsfall hos dessa män. Trots många olika palliativa behandlingar mot metastaser, finns det ingen tillgänglig behandling som botar för närvarande. 80% av alla prostatacancermetastaser sprider sig till skelettben. Man tror att ömsesidiga interaktioner mellan tumör- och benceller stödjer etableringen och expansionen av cancercellerna i skelettet.
RNA-modifierande enzymer är, som deras namn beskriver, en grupp av enzymer som utför modifieringar i... (More) - En potentiell biomarkörer för prostatacancer metastaser
Prostatacancer (PCa) är den vanligaste cancerformen hos män i industriländer. Då den primära tumören inte längre är en stor utmaning för dagens medicin, är den metastaserande sjukdom den främsta orsaken till cancerrelaterade dödsfall hos dessa män. Trots många olika palliativa behandlingar mot metastaser, finns det ingen tillgänglig behandling som botar för närvarande. 80% av alla prostatacancermetastaser sprider sig till skelettben. Man tror att ömsesidiga interaktioner mellan tumör- och benceller stödjer etableringen och expansionen av cancercellerna i skelettet.
RNA-modifierande enzymer är, som deras namn beskriver, en grupp av enzymer som utför modifieringar i RNA-molekylen. Dessa modifieringar är vanliga i kroppens friska celler och är involverade i många biologiska processer såsom RNA metabolism och mRNA splitsning. Senaste forskningen visar att dysreglering av RNA-modifierande enzymer är associerad med dålig prognos av flera olika cancertyper.
I detta arbete undersökte vi hur benmikromiljö påverkar genuttrycket av RNA-modifierande enzymer i prostatacancerceller. För detta använde vi oss av en in vitro modell där vi inkuberade två olika PCa cellinjer 22RV1 och PC3 i normal och osteoblast-konditionerat medium (Obcm) och jämförde genuttrycket av 89 olika RNA-modifierande enzymer mellan de olika medierna. Experimentet avslöjade vilka enzymer var upp- och nedreglerade i benmediet i jämförelse med det normala tillväxtmediet. Med detta som utgångspunkt, fortsatte vi med en databaserad analys av PCa patientkohorter för enzymerna uppreglerade i Obcm och upptäckte att ett individuell enzym var betydande uppreglerad i benmetastaser jämfört med primära tumörer.
Det uppreglerade enzymet från vår analys är ett protein som utför m6A metylering av RNA, vilket betyder att det tillsätter en metylgrupp till en adenosin i RNA molekylen. Funktionella analyser av m6A gjordes för enzymet efter nedtystning av genen, viket resulterade i 50% reduktion av metyleringen av totalt RNA. Dessa uppfinningar tyder på en viktig roll i metylering av RNA för det specifika enzymet.
Masterexamensprojekt i Molekylärbiologi 45 hp 2022/2023
Biologiska institutionen, Lunds universitet
Handledare: Yvonne Ceder, Margareta Persson
Institutionen för laboratoriemedicin, Lunds universitet (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
http://lup.lub.lu.se/student-papers/record/9140746
- author
- Detkiewicz, Klaudia
- supervisor
- organization
- course
- MOBN02 20222
- year
- 2023
- type
- H2 - Master's Degree (Two Years)
- subject
- language
- English
- id
- 9140746
- date added to LUP
- 2023-11-01 15:47:15
- date last changed
- 2023-11-01 15:47:15
@misc{9140746, author = {{Detkiewicz, Klaudia}}, language = {{eng}}, note = {{Student Paper}}, title = {{In vitro screening for key RNA modifying enzymes in prostate cancer metastases}}, year = {{2023}}, }