Kvantitativ modellering av celltillväxt vid exponering av giftiga substanser – en analys av holografiska experiment
(2024) STAH11 20162Department of Statistics
- Abstract (Swedish)
- Denna uppsats är skriven på uppdrag av ett företag som har utvecklat ett mikroskop för att stödja forskning av celler. Mikroskopet är det första som kan ta detaljerade bilder av celler vid olika utvecklingsfaser och är avsedd att hjälpa forskare att förstå cellers beteende, utveckling och tillväxt under cellens livstid. De experiment och den förberedande statistiska behandlingen av mätningarna som vår analys grundar sig på har gjorts av företaget. Huvudsyftet med uppsatsen är att undersöka och belysa de tillhandahållna cellexperimentens statistiska egenskaper samt även för att avgöra om det finns någon statistiskt säkerställd behandlingseffekt på cellernas tillväxt/tillväxthastighet när de odlas i ett medium med tillsatta giftiga... (More)
- Denna uppsats är skriven på uppdrag av ett företag som har utvecklat ett mikroskop för att stödja forskning av celler. Mikroskopet är det första som kan ta detaljerade bilder av celler vid olika utvecklingsfaser och är avsedd att hjälpa forskare att förstå cellers beteende, utveckling och tillväxt under cellens livstid. De experiment och den förberedande statistiska behandlingen av mätningarna som vår analys grundar sig på har gjorts av företaget. Huvudsyftet med uppsatsen är att undersöka och belysa de tillhandahållna cellexperimentens statistiska egenskaper samt även för att avgöra om det finns någon statistiskt säkerställd behandlingseffekt på cellernas tillväxt/tillväxthastighet när de odlas i ett medium med tillsatta giftiga substanser i olika doser. Det är också av intresse att analysera och modellera samt kvantifiera cellernas tillväxthastighet (deras celldelningsintensitet) under en längre tidsperiod (48 timmar) och hur den påverkas av aktuell dos. Studien, analysen och modelleringen görs med hjälp av enkel och multipel regressionsanalys.
Resultaten i uppsatsen har bland annat betonat vikten av kontrollgruppen i varje experiment. Jämförelser mellan kontrollgrupperna avslöjar även experimenteffekter samt korrelationen mellan initialt cellantal och tillväxthastighet, där färre initialceller leder till högre tillväxt. Residualanalyser har påvisat att modellen uppfyller antaganden för kontrollgruppen och lägre doser, medan högre doser uppvisar negativa tillväxtkoefficienter. En möjlig förklaring är att giftpåverkan hämmar celltillväxten för högre doser och att celldelningsprocessen fungerar annorlunda vilket inte ger tillförlitlig mäteffekt. Statistiken och modelleringen i experimentet bör därför baseras på celldelningsintensiteten, särskilt under logfasen av celldelningscykeln. En logaritmisk transformation av cellantalet, log(Y) är särskilt lämplig för att fånga den exponentiella tillväxtfasen (log-fasen) hos en cellkultur. För låga doser av giftet/preparatet kan effekterna på celldelningsintensiteten kvantifieras enkelt med hjälp av linjär regressionsmodell. Den gemensamma regressionsmodellen för dos och kontroll indikerade en korrelation mellan position och dos, vilket ledde till att variabeln position uteslöts och endast tid och dos användes som förklarande variabler. Resultatet blev en mindre tillfredsställande skattning av tillväxthastigheterna. En möjlig förklaring till detta kan vara den varierande påverkan av giftmängden vilket komplicerade kvantifieringen av effekten.
Det är värt att notera att för samtliga experiment är den skattade tillväxthastigheten avsevärt lägre vid de höga doserna, dos tre och fyra, än för kontrollgrupperna samt experimenten vid dos ett och två. (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
http://lup.lub.lu.se/student-papers/record/9161230
- author
- Nguyen, Thi My Hanh LU and Antunovic Olivera, Viktoria LU
- supervisor
- organization
- alternative title
- Kvantitativ modellering av celltillväxt vid exponering av giftiga substanser – en analys av holografiska experiment
- course
- STAH11 20162
- year
- 2024
- type
- M2 - Bachelor Degree
- subject
- keywords
- Celltillväxt, Cellantal, Kontrollgrupp, Dos, Position, Brunn, Regressionsanalys
- language
- Swedish
- id
- 9161230
- date added to LUP
- 2024-06-11 09:59:12
- date last changed
- 2024-06-11 09:59:12
@misc{9161230,
abstract = {{Denna uppsats är skriven på uppdrag av ett företag som har utvecklat ett mikroskop för att stödja forskning av celler. Mikroskopet är det första som kan ta detaljerade bilder av celler vid olika utvecklingsfaser och är avsedd att hjälpa forskare att förstå cellers beteende, utveckling och tillväxt under cellens livstid. De experiment och den förberedande statistiska behandlingen av mätningarna som vår analys grundar sig på har gjorts av företaget. Huvudsyftet med uppsatsen är att undersöka och belysa de tillhandahållna cellexperimentens statistiska egenskaper samt även för att avgöra om det finns någon statistiskt säkerställd behandlingseffekt på cellernas tillväxt/tillväxthastighet när de odlas i ett medium med tillsatta giftiga substanser i olika doser. Det är också av intresse att analysera och modellera samt kvantifiera cellernas tillväxthastighet (deras celldelningsintensitet) under en längre tidsperiod (48 timmar) och hur den påverkas av aktuell dos. Studien, analysen och modelleringen görs med hjälp av enkel och multipel regressionsanalys.
Resultaten i uppsatsen har bland annat betonat vikten av kontrollgruppen i varje experiment. Jämförelser mellan kontrollgrupperna avslöjar även experimenteffekter samt korrelationen mellan initialt cellantal och tillväxthastighet, där färre initialceller leder till högre tillväxt. Residualanalyser har påvisat att modellen uppfyller antaganden för kontrollgruppen och lägre doser, medan högre doser uppvisar negativa tillväxtkoefficienter. En möjlig förklaring är att giftpåverkan hämmar celltillväxten för högre doser och att celldelningsprocessen fungerar annorlunda vilket inte ger tillförlitlig mäteffekt. Statistiken och modelleringen i experimentet bör därför baseras på celldelningsintensiteten, särskilt under logfasen av celldelningscykeln. En logaritmisk transformation av cellantalet, log(Y) är särskilt lämplig för att fånga den exponentiella tillväxtfasen (log-fasen) hos en cellkultur. För låga doser av giftet/preparatet kan effekterna på celldelningsintensiteten kvantifieras enkelt med hjälp av linjär regressionsmodell. Den gemensamma regressionsmodellen för dos och kontroll indikerade en korrelation mellan position och dos, vilket ledde till att variabeln position uteslöts och endast tid och dos användes som förklarande variabler. Resultatet blev en mindre tillfredsställande skattning av tillväxthastigheterna. En möjlig förklaring till detta kan vara den varierande påverkan av giftmängden vilket komplicerade kvantifieringen av effekten.
Det är värt att notera att för samtliga experiment är den skattade tillväxthastigheten avsevärt lägre vid de höga doserna, dos tre och fyra, än för kontrollgrupperna samt experimenten vid dos ett och två.}},
author = {{Nguyen, Thi My Hanh and Antunovic Olivera, Viktoria}},
language = {{swe}},
note = {{Student Paper}},
title = {{Kvantitativ modellering av celltillväxt vid exponering av giftiga substanser – en analys av holografiska experiment}},
year = {{2024}},
}