Characterisation of spliced human papilloma virus-16 mRNAs that can express the E5 gene
(2013) MOBT18 20121Degree Projects in Molecular Biology
- Abstract (Swedish)
- Hur humant papillomvirus-16 uttrycker sin E5-onkogen!
Humant papillomvirus (HPV) är ett virus som är starkt associerat med livmoderhalscancer i världen. Årligen dör omkring 250.000 kvinnor på grund av cancern, där typ 16 är den vanligaste orsaken till att cancer har utvecklats. I Sverige är denna cancerform inte lika vanlig tack vare vaccinationsprogrammet som erbjuds till flickor i ung ålder, men årligen upptäcks omkring 450 nya fall av livmoderhalscancer. HPV typ 16 (HPV-16) är dock en större orosfaktor i exempelvis Västafrika, Indien och Mexiko där incidensen av nya fall är hög på grund av skillnader i sexuellt beteende och bristen på organiserade testprovningsprogram.
HPV-16 är ett virus som kodar för flertalet protein som är... (More) - Hur humant papillomvirus-16 uttrycker sin E5-onkogen!
Humant papillomvirus (HPV) är ett virus som är starkt associerat med livmoderhalscancer i världen. Årligen dör omkring 250.000 kvinnor på grund av cancern, där typ 16 är den vanligaste orsaken till att cancer har utvecklats. I Sverige är denna cancerform inte lika vanlig tack vare vaccinationsprogrammet som erbjuds till flickor i ung ålder, men årligen upptäcks omkring 450 nya fall av livmoderhalscancer. HPV typ 16 (HPV-16) är dock en större orosfaktor i exempelvis Västafrika, Indien och Mexiko där incidensen av nya fall är hög på grund av skillnader i sexuellt beteende och bristen på organiserade testprovningsprogram.
HPV-16 är ett virus som kodar för flertalet protein som är starkt reglerade av det stadium som de infekterade epitelcellerna befinner sig i. Proteinerna E6 och E7 är kända onkoproteiner (dvs proteiner som driver infekterade celler åt att utveckla cancer i vävnaden) som uttrycks tidigt efter infektion av en cell. E5-proteinet är dock ett mysterium för forskare då den inte kunnat påvisas i patienter, trots att den har visat sig ha potential för att kunna driva celler till tumörbildning i vävnader när möss innokulerade med E5 stimulerats med östrogen.
Identifiering av HPV-16 mRNA som uttrycker E5-onkogenen.
Vi designade en strategi för att identifiera möjliga mRNA-varianter som kan användas för att producera E5-proteinet. Vi genomförde detta genom att syntetiskt tillverka DNA-sekvenser som exakt motsvarar de olika mRNA-varianter som produceras av HPV-16 vid en naturlig infektion. För att detektera uttrycket av E5 så ersatte vi E5-genen med en sekretoriskt luciferas-gen i våra mRNA-härmande konstrukt. Dessa olika konstrukt transfekterades in i humana celler och nivåerna av sekretoriskt luciferas mättes.
Vi fann att endast en av de många tidiga HPV-16 mRNA-varianter producerade E5 i signifikanta mängder, och vi identifierade också ett sent HPV-16 mRNA som kunde uttrycka E5. Eftersom vi nu vet vilka mRNA-varianter som kan producera E5-protein, kan man undersöka när i virusets livscykel som E5 uttrycks genom att undersöka när de E5-producerande mRNA-varianterna bildas vid infektion.
Vi tror därför att utökad kunskap om HPV-16:s mRNA-molekyler och hur dessa regleras är nyckeln till att reda ut vad det enigmatiska E5-proteinet har för roll i livmoderhalscancer eftersom E5-proteinet i sig är oerhört svårt att detektera i patienter och från cellkulturer i labb.
Vi tror att denna nya kunskap kan användas för att öka förståelsen för hur HPV-associerad cancer utvecklas i människan.
Handledare: Stefan Schwartz
Masterexamensarbete 60 hp i Molekylärbiologi, mikrobiologi, Allmän inriktning, 2013
Biologiska institutionen, Lunds universitet
Avdelningen för Medicinsk mikrobiologi, Medicinska Fakulteten, BMC (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
http://lup.lub.lu.se/student-papers/record/3810248
- author
- Norberg, Christopher
- supervisor
- organization
- course
- MOBT18 20121
- year
- 2013
- type
- H2 - Master's Degree (Two Years)
- subject
- language
- English
- id
- 3810248
- date added to LUP
- 2013-06-11 11:46:45
- date last changed
- 2013-06-11 11:46:45
@misc{3810248,
abstract = {{Hur humant papillomvirus-16 uttrycker sin E5-onkogen!
Humant papillomvirus (HPV) är ett virus som är starkt associerat med livmoderhalscancer i världen. Årligen dör omkring 250.000 kvinnor på grund av cancern, där typ 16 är den vanligaste orsaken till att cancer har utvecklats. I Sverige är denna cancerform inte lika vanlig tack vare vaccinationsprogrammet som erbjuds till flickor i ung ålder, men årligen upptäcks omkring 450 nya fall av livmoderhalscancer. HPV typ 16 (HPV-16) är dock en större orosfaktor i exempelvis Västafrika, Indien och Mexiko där incidensen av nya fall är hög på grund av skillnader i sexuellt beteende och bristen på organiserade testprovningsprogram.
HPV-16 är ett virus som kodar för flertalet protein som är starkt reglerade av det stadium som de infekterade epitelcellerna befinner sig i. Proteinerna E6 och E7 är kända onkoproteiner (dvs proteiner som driver infekterade celler åt att utveckla cancer i vävnaden) som uttrycks tidigt efter infektion av en cell. E5-proteinet är dock ett mysterium för forskare då den inte kunnat påvisas i patienter, trots att den har visat sig ha potential för att kunna driva celler till tumörbildning i vävnader när möss innokulerade med E5 stimulerats med östrogen.
Identifiering av HPV-16 mRNA som uttrycker E5-onkogenen.
Vi designade en strategi för att identifiera möjliga mRNA-varianter som kan användas för att producera E5-proteinet. Vi genomförde detta genom att syntetiskt tillverka DNA-sekvenser som exakt motsvarar de olika mRNA-varianter som produceras av HPV-16 vid en naturlig infektion. För att detektera uttrycket av E5 så ersatte vi E5-genen med en sekretoriskt luciferas-gen i våra mRNA-härmande konstrukt. Dessa olika konstrukt transfekterades in i humana celler och nivåerna av sekretoriskt luciferas mättes.
Vi fann att endast en av de många tidiga HPV-16 mRNA-varianter producerade E5 i signifikanta mängder, och vi identifierade också ett sent HPV-16 mRNA som kunde uttrycka E5. Eftersom vi nu vet vilka mRNA-varianter som kan producera E5-protein, kan man undersöka när i virusets livscykel som E5 uttrycks genom att undersöka när de E5-producerande mRNA-varianterna bildas vid infektion.
Vi tror därför att utökad kunskap om HPV-16:s mRNA-molekyler och hur dessa regleras är nyckeln till att reda ut vad det enigmatiska E5-proteinet har för roll i livmoderhalscancer eftersom E5-proteinet i sig är oerhört svårt att detektera i patienter och från cellkulturer i labb.
Vi tror att denna nya kunskap kan användas för att öka förståelsen för hur HPV-associerad cancer utvecklas i människan.
Handledare: Stefan Schwartz
Masterexamensarbete 60 hp i Molekylärbiologi, mikrobiologi, Allmän inriktning, 2013
Biologiska institutionen, Lunds universitet
Avdelningen för Medicinsk mikrobiologi, Medicinska Fakulteten, BMC}},
author = {{Norberg, Christopher}},
language = {{eng}},
note = {{Student Paper}},
title = {{Characterisation of spliced human papilloma virus-16 mRNAs that can express the E5 gene}},
year = {{2013}},
}