Isothermal filtration calorimetry study of model peptide aggregates
(2013) KEMK07 20131Department of Chemistry
- Abstract
- Isothermal calorimetry measurements were conducted on the homologous peptide series AnK where A is alanine, K is lysine and n=6, 8, 10, in order to determine the enthalpy for the aggregation of the peptides. The obtained curves were then integrated to determine the differential enthalpy of the processes involved. Previous studies into the same peptides showed that the peptides had very different concentrations on which aggregation occurred, these limits were hard to see using this type of technique. Measurements were conducted on different concentrations, temperature, injection volume and with added electrolytes. The resulting graphs showed that the processes involved were very complicated in some cases, further studies surrounding the... (More)
- Isothermal calorimetry measurements were conducted on the homologous peptide series AnK where A is alanine, K is lysine and n=6, 8, 10, in order to determine the enthalpy for the aggregation of the peptides. The obtained curves were then integrated to determine the differential enthalpy of the processes involved. Previous studies into the same peptides showed that the peptides had very different concentrations on which aggregation occurred, these limits were hard to see using this type of technique. Measurements were conducted on different concentrations, temperature, injection volume and with added electrolytes. The resulting graphs showed that the processes involved were very complicated in some cases, further studies surrounding the interpretation of the data gathered is required before any conclusions can be made into the behaviour of the peptide aggregation. (Less)
- Abstract (Swedish)
- Popular summery
I detta kandidatarbete användes som titeln säger kalorimetri, en metod som går ut på att man mäter hur mycket värme som antingen avges eller tas upp av den lösning man mäter på. Den lösning som mätts består av en peptid, som är ett varierande antal aminosyror sammansatta som ett protein, som lösts upp i vatten och sedan tillsätts en ren vattenlösning stegvis medan instrumentet läser av hur mycket värme denna lösning behöver för att hålla samma temperatur som kontrollösningen i ett anslutande kärl, vilket har fyllts med rent vatten. Målet är att mäta värmet som avges eller upptas när ett peptidaggregat, efter utspädning, löser upp sig i vatten.
Det är främst under senare år som denna typen av peptider har studerats... (More) - Popular summery
I detta kandidatarbete användes som titeln säger kalorimetri, en metod som går ut på att man mäter hur mycket värme som antingen avges eller tas upp av den lösning man mäter på. Den lösning som mätts består av en peptid, som är ett varierande antal aminosyror sammansatta som ett protein, som lösts upp i vatten och sedan tillsätts en ren vattenlösning stegvis medan instrumentet läser av hur mycket värme denna lösning behöver för att hålla samma temperatur som kontrollösningen i ett anslutande kärl, vilket har fyllts med rent vatten. Målet är att mäta värmet som avges eller upptas när ett peptidaggregat, efter utspädning, löser upp sig i vatten.
Det är främst under senare år som denna typen av peptider har studerats närmare, mycket på grund av att det tidigare har varit svårt att framställa precis de peptider man vill ha och även svårt att få ut dem rent, dvs. inte en massa olika peptider som man inte vet vilken som är vilken. Men nu när man kan detta är förhoppningen att man ska förstå vad som händer när dessa peptider klumpar ihop sig och bildar större partiklar. Denna typ av hopklumpning är nära relaterat till flera neurodegenerativa sjukdomar som t.ex. Alzheimer’s och Creutzfeldt-Jacob (galna ko-sjukan) och man har förhoppningar om att man skulle kunna hitta behandlingar mot denna typ av sjukdomar om man kan förstå hur de fungerar.
I detta arbete har tre olika peptider studerats, alla med liknande utseende. Samtliga avslutas med en lysin (aminosyra) men de har olika antal alanin (aminosyra) innan; 6, 8 samt 10 stycken. Detta val av ökning av den ena byggstenen beror på att vi vill avgöra hur sammanslagningen av peptider förändras ju mer vattenavstötande vi gör den, både i utseende på partiklarna men även med avseende på hur de slår ihop sig.
För att djupare undersöka detta gjordes även mätningar på lösningarna vid olika temperaturer men även i koksaltlösning istället för vatten.
Upplösningsprocessen verkar vara komplex, det är tydligt efter detta projekt att ytterligare evaluering av dessa data krävs innan några vidare slutsatser kan dras angående dessa peptider. (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
http://lup.lub.lu.se/student-papers/record/4295328
- author
- Persson, Viktor LU
- supervisor
-
- Ulf Olsson LU
- Gerd Olofsson LU
- organization
- course
- KEMK07 20131
- year
- 2013
- type
- M2 - Bachelor Degree
- subject
- keywords
- fysikalisk kemi, Physical Chemistry
- language
- English
- id
- 4295328
- date added to LUP
- 2014-02-14 13:41:43
- date last changed
- 2014-02-14 13:41:43
@misc{4295328,
abstract = {{Isothermal calorimetry measurements were conducted on the homologous peptide series AnK where A is alanine, K is lysine and n=6, 8, 10, in order to determine the enthalpy for the aggregation of the peptides. The obtained curves were then integrated to determine the differential enthalpy of the processes involved. Previous studies into the same peptides showed that the peptides had very different concentrations on which aggregation occurred, these limits were hard to see using this type of technique. Measurements were conducted on different concentrations, temperature, injection volume and with added electrolytes. The resulting graphs showed that the processes involved were very complicated in some cases, further studies surrounding the interpretation of the data gathered is required before any conclusions can be made into the behaviour of the peptide aggregation.}},
author = {{Persson, Viktor}},
language = {{eng}},
note = {{Student Paper}},
title = {{Isothermal filtration calorimetry study of model peptide aggregates}},
year = {{2013}},
}