Skip to main content

LUP Student Papers

LUND UNIVERSITY LIBRARIES

Evaluating the Use of Flow Cytometry for Routine Monitoring of Bathing Water Quailty

Persson, Moa LU (2020) KMBM05 20201
Applied Microbiology
Abstract
This master thesis has investigated if flow cytometry can be used to monitor bathing water quality on the beaches in Southern Sweden. The current method for monitoring the bathing water quality takes 3 days to
get results about the concentrations of fecal indicator bacteria, E.coli and intestinal enterococci, and to get answers if the water is usable or unusable for swimming. These bacteria serve as fecal indicator bacteria since they come from the intestines of warmblooded animals and can therefore indicate fecal contamination in the bathing water. Both E.coli and intestinal enterococci can be potentially harmful and cause diarrhea and other infections if swallowed or in contact with eyes.

Water samples from 18 beaches were collected... (More)
This master thesis has investigated if flow cytometry can be used to monitor bathing water quality on the beaches in Southern Sweden. The current method for monitoring the bathing water quality takes 3 days to
get results about the concentrations of fecal indicator bacteria, E.coli and intestinal enterococci, and to get answers if the water is usable or unusable for swimming. These bacteria serve as fecal indicator bacteria since they come from the intestines of warmblooded animals and can therefore indicate fecal contamination in the bathing water. Both E.coli and intestinal enterococci can be potentially harmful and cause diarrhea and other infections if swallowed or in contact with eyes.

Water samples from 18 beaches were collected during 13 weeks and analyzed with flow cytometry and compared with the traditional fecal indicator bacteria results that were obtained from SYNLAB. The total cell count and percentage of high nucleic acid bacteria in samples were investigated. Overall the project
showed that flow cytometry has a good potential to be used as monitoring tool for bathing water quality, and that high levels of E.coli and intestinal enterococci was connected to high total cell count and high percentage of high nucleic acid bacteria. It was also found that the time point of the sampling was important for the properties of the sample more than the exact location and this opens possibilities to monitor less beaches without compromising safety. The water samples were also filtered, in order to be sequenced in a later project. (Less)
Popular Abstract (Swedish)
I en enda droppe vatten från Öresund finns det ungefär 25 000 bakterier, vilket resulterar i att man kan få i sig en hel del bakterier när man badar i havet, speciellt barn och hundar som inte är så duktiga på att hålla munnen stängd vid bad. Lyckligtvis är de allra flesta av dessa bakterier goda som inte skadar dig men om du haft oturen att bada i vatten med dålig kvalitet kan du bli sjuk av exempelvis E.coli bakterier i vattnet. E.coli som kan vara ett tecken på fekal kontaminering från människa. Med dagens metod för kontroll av badvattenskvalitet tar det tre dagar att ta reda på om badvattnet du badar i är av bra kvalitet eller inte.

I detta projekt har fokus legat på att undersöka om flödescytometri går att använda för att kolla... (More)
I en enda droppe vatten från Öresund finns det ungefär 25 000 bakterier, vilket resulterar i att man kan få i sig en hel del bakterier när man badar i havet, speciellt barn och hundar som inte är så duktiga på att hålla munnen stängd vid bad. Lyckligtvis är de allra flesta av dessa bakterier goda som inte skadar dig men om du haft oturen att bada i vatten med dålig kvalitet kan du bli sjuk av exempelvis E.coli bakterier i vattnet. E.coli som kan vara ett tecken på fekal kontaminering från människa. Med dagens metod för kontroll av badvattenskvalitet tar det tre dagar att ta reda på om badvattnet du badar i är av bra kvalitet eller inte.

I detta projekt har fokus legat på att undersöka om flödescytometri går att använda för att kolla badvattenskvalieteten istället för de traditionella framodlade testerna. Flödescytometri är en metod där man tillsätter flourescerande färg till ett vattenprov. Färgen tränger då in i cellen och färgar dess DNA. När man sedan skickar en laserståle på provet kan man bland annat se hur många bakterier finns i provet och hur stora deras DNA är. Man kan alltså få ut ett fingeravtryck på hur vattnet ser ut på mikroskopisk nivå. Resultatet från flödescytometri är klart enbart några timmar efter man hämtat vattenprovet, vilket skulle vara en enorm skillnad mot de tre dagarna det nu tar.

Under 13 veckor togs prover från 18 olika stränder i Helsingborg och Malmö, som analyserades kontinuerligt. Projeketet indikerar att flödescytometri fungerar att använda som metod för kontroll av badvattenkvaliteten. Detta då prover med högt antal bakterier samt med stort DNA ofta inträffade samtidigt som det fanns höga nivåer av E.coli och andra fekala indikatorbakterier, men givetvis behövs fler prover för att bekräfta detta. Resultaten visar att det är snarare är tidpunkten för provtagningen som är viktig för provets komposition istället för den stranden som provet är tagit ifrån, förutsatt att proverna är tagna inom ett par kilometer ifrån varandra. Detta är ett bra resultat då det indikerar att färre stränder kan övervakas utan att kompromissa med säkerheten. (Less)
Please use this url to cite or link to this publication:
author
Persson, Moa LU
supervisor
organization
alternative title
Utvärdering av flödescytometri för rutinkontroll av badvattenskvalitet
course
KMBM05 20201
year
type
H2 - Master's Degree (Two Years)
subject
keywords
Flow cytometry, Water quality, Applied Microbiology, Teknisk mikrobiologi
language
English
id
9032444
date added to LUP
2020-12-11 14:00:20
date last changed
2020-12-11 14:00:20
@misc{9032444,
  abstract     = {{This master thesis has investigated if flow cytometry can be used to monitor bathing water quality on the beaches in Southern Sweden. The current method for monitoring the bathing water quality takes 3 days to
get results about the concentrations of fecal indicator bacteria, E.coli and intestinal enterococci, and to get answers if the water is usable or unusable for swimming. These bacteria serve as fecal indicator bacteria since they come from the intestines of warmblooded animals and can therefore indicate fecal contamination in the bathing water. Both E.coli and intestinal enterococci can be potentially harmful and cause diarrhea and other infections if swallowed or in contact with eyes.

Water samples from 18 beaches were collected during 13 weeks and analyzed with flow cytometry and compared with the traditional fecal indicator bacteria results that were obtained from SYNLAB. The total cell count and percentage of high nucleic acid bacteria in samples were investigated. Overall the project
showed that flow cytometry has a good potential to be used as monitoring tool for bathing water quality, and that high levels of E.coli and intestinal enterococci was connected to high total cell count and high percentage of high nucleic acid bacteria. It was also found that the time point of the sampling was important for the properties of the sample more than the exact location and this opens possibilities to monitor less beaches without compromising safety. The water samples were also filtered, in order to be sequenced in a later project.}},
  author       = {{Persson, Moa}},
  language     = {{eng}},
  note         = {{Student Paper}},
  title        = {{Evaluating the Use of Flow Cytometry for Routine Monitoring of Bathing Water Quailty}},
  year         = {{2020}},
}